平行多联生物反应器是指利用酶或生物体所具有的特殊功能，在体外进行生物化学反应的装置系统。与化学反应器不同，化学反应器从原料进入到产物生成，常常需要加压和加热，是一个高能耗过程，而反应器则不同，在酶和微生物的参与下，在常温和常压下就可以进行化学合成。因此更有发展前景。
由五部分组成，即池底进水布水系统、池底布水系统与滤料层之间的污泥层、生物填料、池面出水补水系统、以及沼气收集系统。在AF中，厌氧污泥的保留在于两种方式完成，一是细菌在固定的填料表面形成生物膜；二是在反应器的空间内形成细菌聚集体。
平行多联生物反应器的优势：
1）有对照组，可高效的获得结论；
2）实现工艺验证的目的；
3）可实时获得在线的检测参数；
4）可借助软件和控制系统实现复杂的过程控制；
5）可借助软件计算出各种间接参数，甚至实现代谢流计算，实时了解菌体生理指标；
6）通空气或保护气体，实现严格的无氧，半有氧或高耗氧；
7）发酵罐的不同结构可以灵活改变，比如搅拌桨形式；
8）可作为摇瓶和大规格发酵罐的桥梁。
平行多联生物反应器的应用：
适用于细胞，微生物培养研发和生物过程优化应用；
台式规模平行发酵如：好氧、酵母及真菌；小型及台式规模植物悬浮细胞培养；
利用绿藻或竭藻进行生物燃料研发或其他应用；光感细菌如：蓝藻或者绿色硫细菌培养。
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